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スキンク科 
和名 ニホントカゲ 学名 Plestiodon japonicus 分布 北海道〜九州，国後島，壱岐，大隈諸島 
和名 イシガキトカゲ 学名 Plestiodon stimpsonii 分布 石垣島，西表島，波照間島，黒島，小浜島 カナヘビ科 
和名 ニホンカナヘビ 学名 Takydromus tachydromoides 分布 北海道〜九州，伊豆大島，神津島，壱岐，屋久島，種子島，トカラ列島（中之島） 
和名 サキシマカナヘビ 学名 Apeltonotus dorsalis 分布 石垣島，西表島 ヤモリ科 
和名 ニホンヤモリ 学名 Gekko japonicus 分布 本州〜九州，対馬，屋久島〜八重山諸島 
和名 ホオグロヤモリ 学名 Hemidactylus frenatus 分布 南西諸島（徳之島以南） キノボリトカゲ科（アガマ科） バダグールガメ科 
和名 サキシマキノボリトカゲ 学名 Japalura polygonata ishigakiensis 分布 先島諸島 
和名 セマルハコガメ 学名 Cusloclemmys flavomarginata enelynae 分布 石垣島，西表島 ナミヘビ科 
和名 アオダイショウ 学名 Elaphe climacophora 分布 北海道〜九州，国後島，伊豆諸島，壱岐，対馬，薩南諸島，トカラ列島（口之島） 
和名 ヤマカガシ 学名 Rhabdophis tigrinus 分布 本州〜九州，佐渡島，隠岐，壱岐，五島列島，甑島列島，屋久島，種子島 
和名 シマヘビ 学名 Elaphe quadrivirgata 分布 本州〜九州，国後島，伊豆諸島，大隈諸島など 
和名 サキシママダラ 学名 Dinodon rufozomatus walli 分布 先島諸島 タカチホヘビ科 
和名 タカチホヘビ 学名 Achalinus spinalis 分布 本州〜九州，屋久島，種子島
| 両生類 | ||
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アマガエル科 ヒメアマガエル科 
和名 ニホンアマガエル 学名 Hyla japonica 分布 北海道〜九州，対馬，屋久島など 
和名 ヒメアマガエル 学名 Microhyla ornata 分布 奄美諸島，沖縄諸島，先島諸島（与那国島を除く） アカガエル科 
和名 ニホンアカガエル 学名 Rana japonica 分布 本州〜九州，伊豆七島，隠岐，壱岐，大隈諸島など 
和名 ヤマアカガエル 学名 Rana ornativentris 分布 本州〜九州，佐渡島，大隈諸島など 
和名 トノサマガエル 学名 Rana nigromaculata 分布 本州〜九州，大隈諸島 
和名 サキシマヌマガエル 学名 Fejervarya sakishimensis 分布 先島諸島 
和名 ウシガエル 学名 Rana catesbeiana 分布 北海道〜九州，徳之島，沖縄島，石垣島など アオガエル科 
和名 シュレーゲルアオガエル 学名 Rhacophorus schlegelii 分布 本州〜九州 
和名 ヤエヤマアオガエル 学名 Rhacophorus owstoni 分布 石垣島，西表島 
和名 カジカガエル 学名 Buergeria buergeri 分布 本州〜九州 ヒキガエル科 イモリ科 
和名 アズマヒキガエル 学名 Bufo japonicus formosus 分布 本州（山陰地方・近畿地方以東），北海道（函館付近） 
和名 アカハライモリ 学名 Cynops pyrrhogaster 分布 本州〜九州
| 甲殻類 | ||
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オカヤドカリ科 
和名 オオナキオカヤドカリ 学名 Coenobita brevimanus 分布 南西諸島 
和名 ヤシガニ 学名 Birgus latro 分布 琉球列島（与論島以南） サワガニ科 ベンケイガニ科 
和名 サワガニ 学名 Geothelphusa dehaani 分布 北海道〜九州 
和名 ベンケイガニ 学名 Sesarmops intermedium 分布 東北地方以南 イワガニ科 
和名 イソガニ 学名 Hemigrapsus sanguineus 分布 日本全土 ヌマエビ科 
和名 カワリヌマエビ属 学名 Neocaridina denticulata ssp. 分布 日本；中国，韓国 
和名 ミナミヌマエビ 学名 Neocaridina denticulata denticulata 分布 本州（中部以南）〜九州 
和名 ヌマエビ（南部群） 学名 Paratya sp. 分布 北海道〜九州 
和名 ヤマトヌマエビ 学名 Caridina multidentata 分布 本州（房総以南）〜九州，南西諸島 テナガエビ科 ザリガニ科 
和名 コンジンテナガエビ 学名 Macrobrachium lar 分布 南西諸島（トカラ列島以南） 
和名 アメリカザリガニ 学名 Procambarus clarkii 分布 本州〜九州
| 貝類 | ||
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ヤマタニシ科 
和名 アオミオカタニシ 学名 Leptopoma vitreum taivanum 分布 奄美大島以南 
和名 リュウキュウヤマタニシ 学名 Cyclophorus turgidus radians 分布 石垣島，西表島
| 魚類 | ||
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ハゼ科 
和名 ヨシノボリ（シマヨシノボリ） 学名 Rhinogobius sp. 分布 本州〜南西諸島 
和名 ヌマチチブ 学名 Tridentiger brevispinis 分布 北海道〜九州 コイ科 
和名 アブラハヤ 学名 Phoxinus lagowski steindachneri 分布 本州（青森県〜岡山県） 
和名 ホトケドジョウ 学名 Lefua costata echigonia 分布 本州（青森県と中国地方西部以外），四国 メダカ科 
和名 クリアブラウンメダカ 学名 Oryzias latipes var. 分布 なし ナンダス科 ナマズ科 
和名 リーフ・フィッシュ 学名 Monocirrhus polyacanthus 分布 アマゾン川，ギアナ地方 
和名 ナマズ 学名 Silurus asotus 分布 本州〜九州
| 鳥類 | ||
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スズメ目 
和名 ハクセキレイ 学名 Motacilla alba 科 セキレイ科 
和名 ウソ 学名 Pyrrhula pyrrhula 科 アトリ科 
和名 モズ 学名 Lanius bucephalus 科 モズ科 
和名 ツグミ 学名 Turdus naumanni 科 ツグミ科 
和名 ヒヨドリ 学名 Hypsipetes amaurotis 科 ヒヨドリ科 ブッポウソウ目 
和名 カワセミ 学名 Alcedo atthis 科 カワセミ科 キツツキ目 
和名 コゲラ 学名 Dendrocopos kizuki 科 キツツキ科 カモ目 
和名 マガモ 学名 Anas platyrhynchos 科 カモ科 
和名 アヒル 学名 Anas platyrhynchos var.domesuticus 科 カモ科 
和名 コガモ 学名 Anas crecca 科 カモ科 
和名 バリケン 学名 Cairina moschata var.domestica 科 カモ科 キジ目 
和名 インドクジャク 学名 Pavo cristatus 科 キジ科 コウノトリ目 
和名 アオサギ 学名 Ardea cinerea 科 サギ科 
和名 コサギ 学名 Egretta garzetta 科 サギ科
| 哺乳類 | ||
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イヌ科 アライグマ科 
和名 タヌキ 学名 Nyctereutes procyonoides viverrinus 分布 本州〜九州 
和名 アライグマ 学名 Procyon lotor 分布 アメリカ原産の外来種 ネコ科 リス科 
和名 イエネコ 学名 Felis Catus 分布 日本全土 
和名 タイワンリス 学名 Callosciurus erythraeus thaiwanensis 分布 本州，伊豆大島 ウシ科 
和名 石垣牛 学名 Bos primigenuis 分布 八重山諸島 
和名 水牛 学名 Babalus arnee 分布 インド，ネパール，ブータン，ベトナム，タイ 
和名 リュウキュウヤギ 学名 ? 分布 ？ オオコウモリ科 モグラ科 
和名 ヤエヤマオオコウモリ 学名 Pteropus dasymallus yaeyamae 分布 宮古島，八重山諸島 
和名 ヒミズ 学名 Urotrichus talpoides 分布 本州〜九州
| 菌類 | ||
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ハラタケ目 
和名 エノキタケ 学名 Flammulina velutipes 分布 本州，他不明 
和名 タマゴタケ 学名 Amanita hemibapha 分布 本州，他不明 チャワンタケ目 ホコリタケ目 
和名 オオトガリアミガサタケ 学名 Morchella elata 分布 本州，他不明 
和名 ホコリタケ 学名 Lycoperdon perlatum 分布 本州，他不明 不明 
和名 チチドコモダケ 学名 ? 分布 日本全土
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